Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ArxO35085 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ArxO35085 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ArxO35085 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ArxO35085 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ArxO35085 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ArxO35085 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ArxO35085 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ArxO35085 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ArxO35085 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ArxO35085 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArxO35085 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ArxO35085 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ArxO35085 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArxO35085 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ArxO35085 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms