Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CckarO08786 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckarO08786 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckarO08786 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckarO08786 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckarO08786 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms