Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MttpO08601 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MttpO08601 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MttpO08601 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MttpO08601 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MttpO08601 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MttpO08601 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MttpO08601 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MttpO08601 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MttpO08601 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MttpO08601 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms