Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms