Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3278L7N2D2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3278L7N2D2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3278L7N2D2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3278L7N2D2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3278L7N2D2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3278L7N2D2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3278L7N2D2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms