Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 659.4 ms