Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r80L7N1Z3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r80L7N1Z3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms