Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms