Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim34bJ3QNR8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim34bJ3QNR8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms