Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm21976J3QNN2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Gm21976J3QNN2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Gm21976J3QNN2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Gm21976J3QNN2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Gm21976J3QNN2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Gm21976J3QNN2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Gm21976J3QNN2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21976J3QNN2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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