Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lipo1J3QME6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms