Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm21060J3KMU4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm21060J3KMU4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms