Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AK157302I3ITR1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms