Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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