Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms