Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcf11G3X9Z4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms