Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pnmal2G3X9N3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnmal2G3X9N3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms