Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfgef1G3X9K3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms