Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms