Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer4cG3UXD1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms