Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17455G3UW87 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17455G3UW87 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17455G3UW87 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms