Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M1F7CXU4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms