Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms