Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp946F6VWU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms