Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1bF6V0H0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pagr1bF6V0H0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms