Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BC067074F6RXI4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC067074F6RXI4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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BC067074F6RXI4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC067074F6RXI4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BC067074F6RXI4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC067074F6RXI4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC067074F6RXI4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC067074F6RXI4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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