Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms