Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp17lbE9Q9U0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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