Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms