Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430078G23RikE9Q7Y4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430078G23RikE9Q7Y4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms