Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UtrnE9Q6R7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UtrnE9Q6R7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms