Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srsf11E9Q6E5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srsf11E9Q6E5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms