Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BC005561E9Q5E2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms