Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tarbp1E9Q368 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms