Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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