Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd2E9Q1M1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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