Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcom1E9PZ54 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gcom1E9PZ54 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms