Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim5E9PV98 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms