Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl3E0CZ16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms