Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930455H04RikD3Z622 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms