Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim12cD3Z3L3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12cD3Z3L3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim12cD3Z3L3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim12cD3Z3L3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12cD3Z3L3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12cD3Z3L3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12cD3Z3L3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms