Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
3425401B19RikD3Z1D3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
3425401B19RikD3Z1D3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms