Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30cD3YVI9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30cD3YVI9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms