Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nxpe3B9EKK6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms