Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce3B5KM66 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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