Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf11cB4XVP9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms