Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc11B2RXC1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc11B2RXC1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc11B2RXC1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc11B2RXC1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc11B2RXC1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc11B2RXC1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms