Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms