Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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