Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Abcc8B2RUS7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc8B2RUS7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc8B2RUS7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms